莫愁湖公园的花卉馆，这里有大量海棠树，每年春季，海棠花便会盛开，有红的、有白的、有粉的等等，因此莫愁湖公园每年也会举行一年一度的海棠花会。从日本引进的大批鸢尾花卉，也在鸢尾专类园与游客见面。鸢尾专类园坐落在院内北圩水榭周边。是国内首家品种最多、栽植规模最大的菖蒲专类园。园中菖蒲遍植，以道路为界划分为黄菖蒲栽植区、燕子花栽植区、溪荪栽植区、品种栽植区。
园内花卉品种丰富、色彩艳丽、花瓣各异、花型多变，形成了美丽的自然景观。鸢尾专类植物不同品种分别适生于旱地、水体不同的生态环境，是一类观赏价值很高的园林花卉。经过多年的引种栽培，现有品种花菖蒲为 214个、燕子花4个、溪荪53个。
